| Версия | 4.5 |
|---|---|
| Ношир | Bioinformatics Solutions |
| Рӯзи нашр | 10 Май 2010 |
| Санаи иловашуда | 16 Июл 2010 |
| Талаботи ОС | Windows XP/Vista/7 |
| Талабот | None |
| Боргирии умумӣ | 9 464 |
| Боргириҳо дар як ҳафта | 9 |
| Нарх | Free |
Тавсифи
RAPTOR як нармафзори инноватсионӣ мебошад, ки барои пешгӯии дақиқи сохтори сафеда пешбинӣ шудааст. Он асбобҳои пешрафтаи таҳлилро дар як ҳалли ҳамҷояшудаи нармафзор муттаҳид мекунад ва се усули гуногуни риштагиро фароҳам меорад. Усули беназири оптимизатсияи барномасозии RAPTOR барои дарёфти қолибҳои сохтори ҳадафҳо бо гомологияи пайдарпай паститарин самараноктар аст ва қодир аст моделҳои баландсифатро тавлид кунад. Интерфейси ба осонӣ истифодашаванда ва арзишҳои E барои фаҳмидаашон барои шурӯъкунандагон ва коршиносон беҳтарин мебошанд. Пеш аз ҳама, намоиши интуитивии натиҷа ба корбарон имкон медиҳад, ки натиҷаҳоро танҳо бо як назар фаҳманд. Бо назардошти пайдарпаии сафедаи мақсаднок, агар сафедаи гомологӣ бо сохтори 3D маълум бошад, онро бо истифодаи асбобҳои ҷустуҷӯи пайдарпай, ба монанди PSI-BLAST, ки дар RAPTOR пешниҳод шудааст, пайдо кардан мумкин аст. Сохтори ҳадаф пас аз сохтори маълум сохта мешавад; аммо, вақте ки гомологияи пайдарпаӣ аҳамият надорад, яъне камтар аз 25%, PSI-BLAST наметавонад бо зарбаи боэътимод баромад кунад. Баръакси PSI-BLAST, ки танҳо ҷустуҷӯи пайдарпаӣ, риштаи сафеда, шинохтани қатро истифода мебарад, ҳам маълумоти гомологӣ ва ҳам сохтро истифода мебарад. Он пайдарпаии сафедаро бо сохтори номаълум ба пойгоҳи додаҳои сохторҳои маълум скан мекунад. Бо истифода аз функсияи ҳисобкунӣ ва таҳлили мутобиқат байни сохторҳои сеандоза ва пайдарпаии сафедаи хаттӣ, беҳтарин қолаби сохторӣ муайян карда мешавад, ки аз он сохтори пайдарпаиро сохтан лозим аст. Дар натиҷа, риштаи сафеда пешгӯии олӣ нисбат ба моделсозии гомологӣ медиҳад, вақте ки гомологияи пайдарпаии ҳошия вуҷуд дорад.
